Eeuwenlang werd aangenomen dat de inhoud van de brieven verloren was gegaan.
Tot een cryptograaf, een muziekprofessor en een natuurkundige de cryptische brieven opeens tegenkwamen tijdens hun zoektocht in de onlinearchieven voor gecodeerde documenten van de Bibliothèque Nationale de France. Volgens de archieven zou het om Italiaanse papieren gaan, maar toen ze het geavanceerde cijfersysteem langzaam maar zeker oplosten, bleken het Franse teksten te zijn van Mary uit de periode 1578 tot 1584, een paar jaar voor haar executie.
Professor Lasry en zijn collega’s denken dat er nog meer gecodeerde brieven van Mary kunnen opduiken. want uit historische bronnen valt af te leiden dat er nog een aantal ontbreken.